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5 décembre 2014
Maison de la Chimie
Milieux de culture chromogènes : une microbiologie en couleur
Olivier GAILLOT
CHU de Lille
⤢
48e JBP - 2014 - O. GAILLOT
Introduction
Milieux chromogènes : principes
Une base très classique
Le cœur de la technique : les substrats chromogènes
Substrat incolore d’un enzyme bactérien d’intérêt diagnostic
Principaux chromogènes
Exemple de milieu Clostridium difficile, 18 h
Chromogènes sensu stricto
Substrats chromogènes indolyliques
Un monde très coloré
Un monde trop coloré ?
Principaux enzymes détectables
Petite histoire des milieux chromogènes
À la recherche de l’indican
Le clonage chez E. coli : X-Gal et crible blanc-bleu
Alain Rambach
Principales utilisations biocliniques
Détection d’un pathogène spécifique dans une flore polymicrobienne
Détection d’un pathogène multirésistant dans une flore polymicrobienne
Exemple de milieux chromogènes commercialisés
Yersinia enterocolitica entéropathogène
Exemple de milieux chromogènes commercialisés … pour l’environnement
Note
Limites des méthodes chromogènes
Coût des milieux chromogènes
Le biologiste et les milieux chromogènes
Le biologiste et les milieux chromogènes (2)
Milieux chromogènes : au-delà des indications
Colonies sur milieux chromogènes et identification par SM MALDI-TOF
Qualité des spectres de masse
Résultats d'identification
Associer milieux chromogènes et SM MT ?
Infection de prothèse de hanche (24 h, 37°C)
Echantillonage robotisé après reconnaissance optique
En conclusion
Perspectives
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